东巴文化博物馆以东巴文化为特色，占地7亩，包括历史、自然、艺术在内的综合性民族民俗博物馆。博物馆主体建筑形式为仿古纳西族四合院式，根据地形地貌，充分利用山水环境条件，形成以群体院落作为主体建筑带的古建筑。
丽江纳西东巴文化博物馆建筑按纳西族民居的发展进行布局，利用玉泉水源和象山西麓的自然景观，由北向南开辟了古人类洞穴居、巢居、半穴居、帐篷居、干栏居以及木楞房、三坊一照壁、四台五天井等不同阶段的传统民居，并在其中展出反映各时期纳西族生产力水平的民俗文物资料。